Contenido
- Preparación de la muestra
- Construcción automática de secuenciadores de ADN
- Inyección automática
- Detector
Los científicos tienen la capacidad de secuenciar la molécula de ADN; en otras palabras, pueden determinar el orden de las bases de nucleótidos en cualquier molécula dada. La secuenciación de la molécula de ADN puede ser el primero de una serie de pasos necesarios para descubrir cómo los nucleótidos específicos en una molécula de ADN interactúan entre sí y codifican diferentes características en un organismo. El proceso de secuenciación de ADN está bastante involucrado, pero los secuenciadores automáticos de ADN están minimizando la participación humana necesaria, al menos durante parte del proceso.
Preparación de la muestra
Para que un secuenciador automático de ADN funcione, debe detectar las cuatro bases de nucleótidos que forman el ADN: adenina, guanina, timina y citosina. Los científicos copian un trozo de ADN muchas veces y usan enzimas de restricción para cortar el ADN en trozos de diferentes tamaños. Luego agregan una pequeña cantidad de base fluorescente marcada a cada lote de ADN. La base, que es adenina, timina, guanina o citosina, se unirá a su complemento base en el extremo de una hebra. Por ejemplo, la adenina se unirá a las hebras que terminan en timina, y la guanina se unirá a las hebras que terminan en citosina.
Construcción automática de secuenciadores de ADN
Un secuenciador de ADN automático está construido de manera muy similar a un secuenciador de ADN que requiere más trabajo manual. Específicamente, un secuenciador automático de ADN es un tanque, de aproximadamente 1 pie de largo, con 96 pozos de gel en los que se puede verter el ADN. En un secuenciador automático de ADN, al igual que en cualquier secuenciador de ADN, el ADN se inyecta en los pocillos de gel en la parte superior del tanque, y se aplica una carga negativa a ese extremo del tanque. La carga negativa proporciona un fuerte impulso para que las hebras de ADN recorran diferentes distancias, hasta el final del tanque.
Inyección automática
Un secuenciador automático de ADN inyecta lotes de ADN, automáticamente, en la parte superior del gel. Como tal, ahorra a los investigadores una enorme cantidad de tiempo y esfuerzo. Después de que se inyectan los lotes, el secuenciador aplica automáticamente una carga negativa a un extremo del tanque, lo que hace que los hilos migren a diferentes distancias a través del gel. Las diferentes distancias reflejan los diferentes tamaños de hebras de ADN que pasan a través del gel.
Detector
Muchas máquinas automáticas de secuenciación de ADN están configuradas para detectar el tinte fluorescente en las hebras de ADN que pasan a través del gel. Al hacerlo, pueden identificar los nucleótidos que se encuentran en los extremos de los filamentos y registrarlos en la computadora. Sin embargo, los secuenciadores, en el mejor de los casos, presentan una versión desordenada de nucleótidos de ADN. Después de usar una máquina automática de secuenciación de ADN, debe pasar por un proceso llamado "acabado", en el que una combinación de computadoras e investigadores clasifican los resultados de la detección de la cadena de ADN para reunir los datos en una descripción completa de una cadena de ADN. No es sorprendente que este proceso pueda llevar mucho más tiempo que el proceso real de secuenciación.