Contenido
- Comprensión básica de empalme alternativo
- Salto de exón
- Exones mutuamente excluyentes
- Sitios alternativos de aceptación de 3 '
- Sitios alternativos de donantes 5
- Retención de intrones
El empalme alternativo es un componente integral de la biodiversidad. Varias especies utilizan estos mecanismos para llevar a cabo funciones reguladoras. La principal ventaja del empalme es que se pueden formar múltiples proteínas a partir de un solo gen a través del empalme de intrones y exones. Sin embargo, estos mecanismos también pueden causar diversas enfermedades si no se regulan. Los mecanismos más comunes son la omisión de exón, exones mutuamente excluyentes, sitios aceptores alternativos, sitios donadores alternativos y retención de intrones.
Comprensión básica de empalme alternativo
••• Comstock / Comstock / Getty ImagesNo es una exageración decir que sin un empalme alternativo, la biodiversidad no sería posible. El empalme alternativo puede producir múltiples proteínas a partir de un solo gen. Esta flexibilidad permite que el mismo gen contribuya a diferentes rasgos. Esto es posible debido a los exones, que son tramos de nucleótidos que permanecen en el producto de ARN, y los intrones, que se eliminan mediante empalme de ARN. Hay muchos modos de empalme alternativo que contribuyen a la biodiversidad en eucariotas. Los activadores, como el codón de inicio AUG, en el sitio de empalme promueven el empalme. Estos mecanismos varían en cada situación y se cree que regulan las funciones celulares en función de condiciones particulares. Sin embargo, el empalme incorrecto también puede contribuir a diversas enfermedades, incluido el cáncer.
Salto de exón
Este mecanismo también se conoce como cassette exón, donde un exón se separa del gen durante la transcripción. Un ejemplo sería el gen dsx en D. melanogaster (mosca de la fruta). Los machos tienen los exones 1, 2, 3, 5 y 6, mientras que las hembras tienen 1, 2, 3 y 4. Una señal de poliadenilación en el exón 4 hace que la transcripción se detenga en ese punto. El exón 4 se agrega a las hembras debido a uno de los activadores presentes solo en las hembras y no en los machos.
Exones mutuamente excluyentes
••• Thomas Northcut / Lifesize / Getty ImagesEn el caso de los exones mutuamente excluyentes, solo uno de los dos exones consecutivos se retiene durante la transcripción. Un ejemplo es la regulación de los exones 8a y 8 en los canales de calcio CaV1.2. En el síndrome de Timothy, las formas alternativas de estos dos exones pueden conducir a diferentes síntomas de la enfermedad, lo que provoca la interrupción de la homeostasis del calcio necesaria para la contracción muscular. Sin embargo, ambos exones no pueden existir en pacientes; solo uno de ellos se transcribe, aunque ambos están presentes en el gen.
Sitios alternativos de aceptación de 3 '
Se usa la unión de empalme en el extremo 3, cambiando el límite 5 del exón aguas abajo. Un ejemplo es la proteína activadora Transformer (Tra) presente en hembras de D. melanogaster (mosca de la fruta). El gen original para Tra contiene dos sitios aceptores donde el gen puede dividirse durante la transcripción. Los machos usan el sitio aceptor aguas arriba, que incluye un codón de parada temprana. Esto forma una proteína no funcional. Las hembras usan el sitio aceptor aguas abajo, lo que hace que el codón de parada se extirpe como parte del intrón, formando una proteína Tra funcional.
Sitios alternativos de donantes 5
••• Imágenes Comstock / Comstock / Getty ImagesSe usa la unión de empalme en el 5 ', cambiando el límite de 3' del exón aguas arriba. Si bien los sitios aceptores alternativos conducen a pequeñas variaciones en las secuencias de proteínas, los sitios donadores alternativos pueden generar diferencias drásticas en la secuencia y estructura de las proteínas porque puede causar cambios de marco. Un ejemplo sería el empalme alternativo del sitio donante del gen BTNL2. El uso del sitio aguas arriba, en lugar del sitio aguas abajo, conduce a una proteína abreviada sin el dominio IgC C-terminal o la hélice transmembrana. Esto da como resultado una predisposición a la enfermedad inflamatoria crónica.
Retención de intrones
Similar al salto de exón, el exón se retiene en el ARNm, pero a diferencia del salto de exón, el exón no está flanqueado por intrones. Si existieran intrones, a menudo se codifican en las regiones de codificación entre los aminoácidos de los exones cercanos, el codón de detención o un cambio en el marco de lectura que hace que la proteína deje de ser funcional. Este es el mecanismo menos común de empalme alternativo.