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La mayoría del trabajo que se realiza en una célula viva lo realizan sus proteínas. Una cosa que una célula tiene que hacer es duplicar su ADN.
En su cuerpo, por ejemplo, el ADN se ha duplicado billones de veces. Las proteínas hacen ese trabajo, y una de esas proteínas es una enzima llamada ADN ligasa. Los científicos reconocieron que la ligasa podría ser útil para construir ADN recombinante en el laboratorio, por lo que incorporaron un paso de ligadura en el proceso de creación de ADN recombinante.
La estructura del ADN.
Una sola cadena de ADN consiste en una secuencia de bases nitrogenadas que siguen las abreviaturas A, T, G y C. Normalmente, el ADN se encuentra en una cadena doble, donde una secuencia larga de bases se corresponde con otra cadena igualmente larga de bases.
Las dos cadenas son complementarias, en el sentido de que una cadena tiene una A, la otra tiene una T, y donde una tiene una G, la otra tiene una C. La A y la T coinciden entre sí a través de un enlace químico débil llamado enlace de hidrógeno, y G y C hacen lo mismo.
En total, las dos cadenas complementarias se unen entre sí a través de muchos enlaces de hidrógeno. Cada una de las dos cadenas individuales mantienen sus propias bases nucleares junto con un enlace más fuerte en forma de una larga cadena de grupos de azúcar y fosfato conectados covalentemente.
Función de ligasa
Puedes pensar en una cadena de ADN como una pulsera larga con cuatro tipos diferentes de amuletos. Los encantos simplemente cuelgan de la fuerte cadena que los conecta.
La replicación de ADN construye otro brazalete de encanto que coincide con el primero. Donde haya un amuleto A en el primer brazalete, un amuleto T se ajustará en el segundo brazalete, y lo mismo para C y G.
Los encantos en la segunda pulsera pueden coincidir con la primera pulsera sin estar en una pulsera. Es decir, pueden conectarse a la cadena opuesta a través de una conexión débil sin tener una cadena fuerte para conectarlos con sus vecinos.
La enzima ADN ligasa detecta los lugares donde se rompe la cadena de azúcar y fosfato, y reconstruye el enlace, conectando los grupos de azúcar y fosfato en un enlace fuerte.
ADN recombinante
El ADN recombinante es el resultado de cortar una doble cadena de ADN y conectarlo a otra doble cadena. Cada hebra doble a menudo se corta de manera desigual, con una hebra que termina unas pocas bases por debajo de la otra.
Hay bases adicionales que cuelgan de un extremo, como en TTAA, por ejemplo. La otra cadena doble tiene bases adicionales en una secuencia como AATT. Los dos conjuntos de bases adicionales, llamados "extremos adhesivos", se unen entre sí a través de sus débiles enlaces de hidrógeno.
Pensando en las pulseras de dijes nuevamente, imagina que tienes una pulsera de dijes dobles con dos cadenas conectadas solo a través de sus dijes. Cortas el extremo, pero cortas un extremo cuatro encantos menos que el otro, por lo que hay una pequeña cola colgando.
Haces lo mismo con otra pulsera de doble encanto. Si los cuatro encantos se complementan entre sí, los dos encantos cortados se conectarán, pero solo a través de sus encantos.
Enzima ligasa utilizada en la recombinación
En el paso anterior de la recombinación de ADN, se han conectado extremos adhesivos de dos moléculas de ADN bicatenarias diferentes. Sin embargo, la única conexión entre las dos secciones es a través de los enlaces débiles. Al igual que el brazalete de encanto conectado solo a través de los encantos a juego, sería fácil separarlos.
La enzima ADN ligasa encuentra los lugares donde los grupos de azúcar y fosfato no están conectados entre sí y los une. Nuevamente, al igual que el brazalete de dijes, después de que la ADN ligasa atraviesa y encadena las bases, la nueva molécula de ADN de doble cadena más larga está fuertemente conectada.