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La transferencia Western es uno de los procedimientos más comunes en los laboratorios bioquímicos. Básicamente, separa las proteínas de una muestra por tamaño, luego las pruebas usando anticuerpos para determinar si una proteína dada está presente. Es útil no solo en investigación sino también en laboratorios médicos o de diagnóstico; Las pruebas para el VIH y la enfermedad de Lyme, por ejemplo, implican una prueba de ensayo de inmunosorción ligada a enzimas (ELISA), seguida de una transferencia Western si el ELISA da positivo. A pesar de su popularidad, sin embargo, la transferencia Western tiene varias desventajas.
No cuantitativo
Las transferencias Western clásicas no son cuantitativas. En otras palabras, si bien pueden decir a los investigadores si una proteína en particular está presente, no permiten cuantificar la cantidad de proteína que está presente. Algunas compañías de biotecnología ahora venden kits que permiten a los investigadores o técnicos de laboratorio cuantificar la cantidad de proteína presente usando una curva estándar, pero esto funciona solo si hay disponibles muestras puras de la misma proteína. Además, el peso molecular de una proteína solo puede estimarse con transferencia Western, en lugar de determinarse con precisión como con la espectrometría de masas.
Anticuerpos
Una transferencia Western solo se puede realizar si los anticuerpos primarios contra la proteína de interés están disponibles. Si bien los anticuerpos para muchas proteínas diferentes están disponibles en las compañías de biotecnología, no son baratos; Si los anticuerpos primarios no están disponibles para una proteína dada, no será posible realizar una transferencia Western buscando esa proteína en particular. Además, los investigadores pueden querer determinar si una proteína ha sido modificada de alguna manera, si ha sido fosforilada (tenía un grupo fosfato unido a ella), por ejemplo, y con la técnica de transferencia Western necesitan anticuerpos específicos para la proteína modificada. proteína.
Formación
Puede ser un desafío realizar una transferencia Western correctamente y obtener buenos resultados, por lo que el personal debe estar bien capacitado.En esto como en muchas otras cosas, la experiencia es quizás el mejor tutor; Sin embargo, incluso para un técnico experimentado, una transferencia Western es lenta. La porción de electroforesis en gel del experimento, por ejemplo, típicamente tomará de una a dos horas en ejecutarse. Se pueden realizar otras tareas mientras el gel está funcionando, por supuesto, pero el experimento todavía lleva bastante tiempo para obtener resultados.
Otras limitaciones
Los anticuerpos a veces pueden exhibir cierta unión fuera del objetivo, lo que puede dar lugar a resultados más pobres. Además, con la transferencia Western, usa un anticuerpo contra una proteína específica, por lo que sus resultados solo le dirán si esa proteína estaba presente. La espectrometría de masas de alta resolución, por el contrario, revela todas las proteínas presentes en una muestra y, a diferencia de la transferencia Western clásica, es cuantitativa. Es importante recordar, por supuesto, que la espectrometría de masas es mucho más costosa y también técnicamente más difícil de usar en comparación con la transferencia Western.